El objetivo de este artículo es proponer una metodología para construir un índice regional de costo de vivienda que tome en consideración la heterogeneidad espacial de éstas. Trabajando con la encuesta CASEN 2003, se muestra que los precios promedios entre regiones así como la estimación de regresiones hedonicas pueden generar resultados sesgados producto de la heterogeneidad espacial. Cuando se homogeiniza la muestra a través de método de pareo «matching», los resultados previos cambian en forma significativa. Finalmente se construye un índice regional de costo de vivienda que captura las diferencias regionales en precios de arriendo de unidades homogéneas.